Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSNK2BP67870 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms