Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA6P60900 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms