Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP107P57740 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms