Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD4P55036 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD4P55036 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms