Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POU3F4P49335 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms