Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGM4P49221 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms