Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms