Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQGAP1P46940 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms