Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RANGAP1P46060 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms