Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms