Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGCXP38435 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms