Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms