Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHI3L1P36222 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms