Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC4P35249 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC4P35249 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms