Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms