Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2E2P29084 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms