Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms