Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTX3P26022 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms