Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms