Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRGP23470 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRGP23470 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRGP23470 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRGP23470 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PTPRGP23470 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRGP23470 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRGP23470 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
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