Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRHP20396 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRHP20396 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRHP20396 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRHP20396 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRHP20396 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRHP20396 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms