Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms