Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms