Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms