Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXB3P14651 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms