Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms