Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEFHP12036 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEFHP12036 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms