Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms