Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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