Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP4O75379 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms