Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms