Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD28O15084 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms