Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6BO15054 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms