Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNRNPCL3B7ZW38 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms