Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms