Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DGG1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DGG1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DGG1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DGG1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms