Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms