Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms