Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms