Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms