Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms