Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNRF3Q9ULT6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms