Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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TPCN1Q9ULQ1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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TPCN1Q9ULQ1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPCN1Q9ULQ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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TPCN1Q9ULQ1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TPCN1Q9ULQ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TPCN1Q9ULQ1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TPCN1Q9ULQ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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