Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALD1Q9ULE6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms