Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRTO4Q9UKD2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms