Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms