Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFIP11Q9UBB9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms