Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms