Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms