Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms